Direcția medico-socială este condusă de către un director care coordonează întreaga activitate și se subordonează directorului general adjunct din cadrul Direcției generale de asistență socială Constanța.
Structura Direcției medico-socială cuprinde:
1) Serviciul medicină școlară;
2) Compartimentul asistență medicală comunitară;
3) Centrul pentru persoane fără adăpost Sfânta Filofteia;
4) Centrul de zi pentru integrare/reintegrare socială;
5) Compartimentul de prevenție, derulare și coordonare programe de sănătate.